После основания Венского университета в 1365 году Галеаццо де Санкта Софиа из итальянской Падуи и его австрийский ученик Й. Айгель провели в нём первые, революционные по тем временам анатомические опыты. Так было положено начало научной медицине в Австрии.

К началу 20 столетия венская медицина считалась медициной международного уровня. Клеменс фон Пирке дал определение понятию аллергии и сывороточной болезни, Эрнст Петер Пик проводил имеющие большое значение опыты по химической специфике иммунологических реакций, Венская школа стоматологической медицины (основана Бернгардом Готтлибом) достигла в 20-е годы пика своего расцвета. Все четыре Нобелевские премии по медицине, которые были присуждены в последующие годы венским медикам (работавшим в разное время в Вене) – Роберту Барани (1914), Юлиусу Вагнеру-Жауреггу (1927), Карлу Ландштейнеру (1930), Отто Лёви (1936) – явились оценкой той деятельности, которая проводилась именно в предшествующие годы. Традиции первенства в медицине, первенства в медицинских исследованиях были продолжены во времена первой республики. Созданная в Вене «Американская медицинская ассоциация города Вены» организовала пользовавшиеся большой популярностью курсы усовершенствования для врачей со всего мира, которые работали вплоть до конца 30-х годов.

После 1945 года начался трудный период восстановления Вены, в том числе и в области медицины. Прежняя слава явно поблекла. Ко всему прочему в 1949 году 75 процентов студентов медицинского факультета Венского университета были исключены по причине их нацистского прошлого и последовательно заменены представителями поколения, получившими свои знания уже в новых условиях. Эта двойная брешь в медицине города Вены, возникшая в течение немногих лет, была ликвидирована только спустя несколько десятков лет.

Благодаря коренной перестройке и модернизации, проведённой за десятки лет после окончания войны, облик больниц сильно изменился. В 22-м районе Вены была построена и оборудована совершенно новая больница – Донаушпиталь. Она создавалась с 1985 до 1996 года как часть СМЦ-Ост (Социальный медицинский центр – Ост). Другим масштабным проектом явилось строительство больничного комплекса фонда Рудольфа. Старая больница была построена по приказу императора Франца-Иосифа в память о рождении его наследника – кронпринца Рудольфа. Так как здание полностью устарело, то на замену ему в период с 1965 по 1977 год было построено совершенно новое сооружение.

Здравоохранение города Вены занимает по всем релевантным параметрам лидирующее положение в Австрии. Венские учреждения здравоохранения располагают лучшим в мире оборудованием для работы персонала, большая часть сложного медицинского обслуживания осуществляется в Вене и большинство больничных мест, предназначенных для пациентов со сложными заболеваниями, также находится в федеральной столице.

Для того чтобы осуществить модернизацию здравоохранения, в Венском объединении больничных учреждений в 2004 году было создано собственное долевое предприятие, объединяющее «Дома престарелых города Вены».

КАФ принимает широкое участие в международных программах по оказанию помощи, разработанных в рамках внешних связей министерства здравоохранения. Объединение больничных учреждений осуществило в 2004 году 17 проектов за рубежом.

В Вене на севере австрийской столицы до 2011 года будет построена новая больница на 450 мест стоимостью примерно 250-300 миллионов евро.

Новая концепция размещения больничных учреждений призвана учесть произошедшие в Вене демографические изменения, а также принцип равномерного распределения по регионам.